Оставить слои , где всё нужное, открытыми, остальные закрыть. Если всё на одном слое или перемешаны неудобным образом, то создать новые и на них переместить нужные элементы, остальные закрыть. После этого сохранить файл как и выбрать из списка нужный растровый формат.