Нет, Илья. Логика тут самая железная. Если попросту, то это выглядит примерно так.
Когда грузишь всю модель в 3Д, при построении проверяется только одно условие: делать все полностью. Сначала каркас, потом с удалением невидимого, потом раскраска и тени. Эти этапы присутствуют всегда, при любом 3Д построении.
Если ты даешь задание на построение куска модели, то первые три этапа все равно имеют место, а вот потом уже начинается проверка дополнительных условий по всем объектам, составляющим модель. Условия могут быть, к примеру, такие: попадает ли объект в требуемый кусок, если попадает, то весь или его часть, если часть, то какая? и т.д. На все это требуется время и ресурсы. Отсюда и увеличение времени на обработку.