Нашел простой способ, может кому пригодиться:
Если в проектах разные отметки этажей, и совместить дома без нарушения уровней не получается, делаем так:
в проекте в который вставляем, создаем выше существующих этажи с аналогичными высотами проэкта из которого вставляем.
Групируем в 3д дом, и вставляем его на эти этажи, а потом опускаем до нужного уровня. Всем спасибо.