Если я чего-то не понимаю, объясните, пожалуйста...
ArchiCAD бы посчитал, если бы было что считать. Есть плинтус - будет расчет. Нет плинтуса - он расчет из воздуха не сделает.
Если пересчитываю калькулятором (даже просто периметр помещения или площадь) мои подсчёты часто не совпадают с АС.
Тут надо разбираться, как Вы считаете, а какой метод расчета ему подсунули.
И как посчитать периметр плинтуса автоматически (стены без проёмов, грубо говоря)?
Расставить плинтус. Потом можно посчитать и автоматически. А у зоны "спрашивать" сколько надо плинтуса за вычетом проемов - она навряд ли скажет. Только свой периметр.
П.С. Обычно плинтус заказываю столько же, сколько и периметр комнаты. Ширина проема как раз будет содержать % на отходы.