bruce333, Если вы работаете через модули это не значит, что все что есть на этаже, должно быть в этом модуле! (вроде кто-то любил делать модуль из самого файла напрямую, из-за этого пошла путаница).
Попробую объяснить строю модель подвал, 1 этаж, 2 типовой, не строю 3...9, Кровля. То есть 3-9 не строю. На втором этаже построены стены, перекрытия лестница и расставлены зоны, маркеры квартир не ставляю. На втором этаже выделяю все что должно входить в модуль, сохраняю это выделение в набор (для удобства 1 раз), потом СОХРАНЯЮ ВЫДЕЛЕННОЕ КАК МОДУЛЬ. Размещаю модули на 3-9 этаже.
Если что то изменяется правлю на 2 этаже, быстро выделяю так как есть сохраненный набор, и снова сохраняю как модуль заменяя файл модуля. Если появляется новые элементы не забываю добавлять в набор. (то-есть работаю в одном файле, файл модуля для правки не открываю вообще). Там еще удобная фишка получается если сохраняешь файл модели автоматически просит обновить модули.
Далее расставляю паспорт квартиры, на всех этажах. (1-9) на 2 этаже тоже, но его не добавляю в выделение чтобы он в модуль не входил. Ксати если у вас сложный фасад и на нем разные по этажам элементы то они тоже не входят, а строятся в основном файле на каждом этаже.
Получается файл 1 модель в котором работаю, 2 модуль лежит в папке некто его не трогает, а если потеряется всегда можно сохранить новый из модели. Зоны находятся и в модели и в модуле, а паспорта только в модели.