Выделяете окно, нажимаете правой кнопкой (в окне 3D редактирования), в контекстном меню выбираете - преобразовать в морф. Окно превратится в морф, а все составные части объекта станет возможно редактировать (рама-отдельно, стекло-отдельно), стекло выделить и удалить. Я бы посоветовал делать так: выбираете нужное окно - дублируете его в то же самое место, где оно стоит, на панели параметров нажимаете на кнопку "пустой оконный проем" (получается у вас в одном и том же месте и проем и окно), а оригинал окна преобразовывать в морф и редактировать. Объясню зачем такая морока: когда вы преобразуете окно в морф, оно автоматически перестанет вычитать проем в стене, так что следует на его месте создать пустой проем по размерам окна.