Встречный вопрос: а зачем нужны отдельные перекрытия?
Допустим, разделили некой операцией, тогда получается, что под стенами не будет куска перекрытия? А если будет, то тогда какое-то перекрытие должно под стены заходить, вручную тоже будете делать?
Если же нужно такое разделение для напольных покрытий, а не перекрытий, то можно поступить следующим образом:
1) в каждом помещении 1 щелчком поставить зону (выбрав режим автоматической привязки к стенам) - получим "бесплатные" контуры помещений;
2) проверяем контуры на предмет правильности - ведь иногда зоны могут забирать часть пространства (тогда доп. настраиваем их);
3) с помощью "волшебной палочки" прощелкиваем еще раз по зонам с выделенным (целевым) объектом "Перекрытие" - получаем на выходе новые объекты с заданными заранее свойствами. Чтобы случайно не попадать в стены при операции преобразования советую временно оттащить все зоны куда-нибудь в пространство на простор на точно заданное расстояние, а позже всё вернуть вместе с полученными перекрытиями на место.
4) получаете и новые "перекрытия", а еще и зоны, которые по-любому пригодятся при экспликации.
Всё.