Вы не знаете, что колонны автоматически вычитают свой объем из стен?
Балки автоматически вычитают свой объем из перекрытий.
Стены автоматически вычитают свой объем из другой стены, если у них разный приоритет пересечения.
Балки и стены автоматически вычитают свой объем из друг друга, тоже исходя из разности приоритета пересечения.
Все это называется автоматическим пересечением.
Чтобы провести SEO в обход автоматического пересечения, ознакомьтесь с разделом справки по операциям над объемными элементами.
Виртуальное здание > Дополнительные средства создания элементов > Операции над объемными элементами