Промежуточных файлов то нет. Есть, так сказать, сборочные единицы - каждое здание в отдельном файле, и есть сборка - рельеф на который посажены здания.
Общая картина видится на сборке. Рельеф с уклоном 7% это вообще не рельеф. Поэтому достаточно одного взгляда, чтобы принять решение.
Файл со зданием и файл с рельефом открыты одновременно. В первом делается сохранение, во втором обновление модуля.
Если, всё таки, так не удобно, то можно организовать по другому.
Рельеф тоже в отдельном файле как сборочная единица. Тогда его можно временно вставлять модулем в файл здания.
Я то на всё это смотрю с той точки зрения, что на каждое здание должен быть полноценный рабочий проект. Если так, то когда каждое здание в отдельном файле, проект удобнее оформлять. В смысле, все эти виды, макеты, их названия, названия чертежей, автотексты и пр.